Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXD12P35452 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXD12P35452 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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