Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNA1P35221 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms