Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC8A1P32418 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms