Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJB2P29033 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms