Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HLA-DMAP28067 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms