Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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