Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AF241726.1-201ENST00000317902 699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RAB30-203ENST00000525117 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC005495.1-201ENST00000586611 1211 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TLR8-AS1-201ENST00000451564 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC010983.1-201ENST00000418387 1028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPS13P2-201ENST00000437890 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPS13-202ENST00000525634 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD20A2-203ENST00000611747 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD20A4-203ENST00000615302 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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