Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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CT47B1P0C2W7 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CT47B1P0C2W7 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms