Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DENRO43583 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DENRO43583 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DENRO43583 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms