Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK4-214ENST00000543431 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms