Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms