Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP1Q9UPQ3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms