Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHPF2Q9P2E5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms