Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM30AQ9NV96 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms