Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CEP44Q9C0F1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms