Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIFKQ9BYG3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NIFKQ9BYG3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms