Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
MAP1LC3CQ9BXW4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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