Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
IFT27Q9BW83 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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