Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
HIGD2AQ9BW72 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
HIGD2AQ9BW72 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms