Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NUP58Q9BVL2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms