Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRACR2AQ9BSW2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms