Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SGCZQ96LD1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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