Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPAP2Q8IXW5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms