Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM78BQ5VT40 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM78BQ5VT40 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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