Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TDRD12Q587J7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms