Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTXN3Q4LDR2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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