Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TWISTNBQ3B726 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms