Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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