Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HADHQ16836 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HADHQ16836 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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