Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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