Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK4Q16099 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms