Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EFR3AQ14156 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms