Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CBFBQ13951 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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