Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALCAMQ13740 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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