Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEUROD1Q13562 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEUROD1Q13562 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms