Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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DUSP4Q13115 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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DUSP4Q13115 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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DUSP4Q13115 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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DUSP4Q13115 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms