Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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FOXF1Q12946 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF1Q12946 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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