Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms