Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARID5AQ03989 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms