Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
E2F1Q01094 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms