Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASIC1P78348 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ASIC1P78348 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms