Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HBBP68871 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
HBBP68871 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms