Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
HERVK_113P63121 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms