Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMC1P62191 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms