Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NCS1P62166 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms