Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SUMO3P55854 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms