Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP7P55210 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP7P55210 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms