Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP3M2P53677 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms