Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CASP4P49662 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CASP4P49662 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CASP4P49662 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CASP4P49662 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms