Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LHX1P48742 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LHX1P48742 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LHX1P48742 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms